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Andei forçando a barra para forçar o travamento do programa, e pude
verificar uma das vantagens do banco de dados separado , os dados do banco
de dados ficaram intactos :0) e o enxuto arquivo .odb foi facilmente
recuperado pelo proprio sistema

Porem a demora nas consultas continuam ocasionando a espera na tela cinza...
mas acabei de achar o que pode ser a solução
aumentar a memoria cache - por padrão ela é de 16384,  (achei este mesmo
valor em 2 micros que estou testando um com 2mb e outro com 4mb de ram)
SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.SETTINGS WHERE NAME =
'info.CACHE_MAX_SIZE'para
ver o valor

aumentei com o comando , na hora de conectar o banco de dados
h2:~/mydb;JMX=TRUE ;CACHE_SIZE=30720
não sei se vai resolver, mas minha meta e ao menos poder trabalhar com uma
tabela com 5000 linhas sem apresentar a tela cinza

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